杀菌剂又称杀生剂、杀菌灭藻剂、杀微生物剂等，通常是指能有效地控制或杀死水系统中的微生物——细菌、真菌和藻类的化学制剂。主要分为农业杀菌剂和工业杀菌剂两种。

农业杀菌剂

一种用于预防和控制各种病原微生物引起的植物病害的农药，一般是指杀菌剂。但在国际上，它通常被用作预防和控制各种病原微生物的药物的总称。随着杀菌剂的发展，杀菌剂、杀毒剂、杀藻剂等亚类被区分开来。

工业杀菌剂

可分为氧化杀菌剂和非氧化杀菌剂两类。氧化性杀菌剂通常为强氧化剂，主要通过与细菌体内代谢酶发生氧化作用而达到杀菌目的。二氧化氯、溴、臭氧、过氧化氢等常用的氧化杀菌剂。非氧化杀菌剂以致毒剂作用于微生物的特殊部位，破坏微生物的细胞或生命体，达到杀菌效果。常见的非氧化杀菌剂有氯酚、异噻唑啉酮、季铵盐等。

根据来源，除农业抗生素属于生物源杀菌剂外，主要品种为化学合成杀菌剂，杀菌剂是一种用于预防和控制植物病害的药物。所有对病原体有杀死作用或抑制生长作用但不妨碍植物正常生长的药物，统称为杀菌剂。杀菌剂可根据作用模式、原料来源和化学成分进行分类。